生物質鍋爐燃燒後的煙氣粉塵粒徑比較小，使得鍋爐煙塵排放不同程度上存在着粉塵排放超標、煙色排放超標或煙色排放超標的狀況。因此 必須采取必要的除塵設備進行凈化。

生物質鍋爐選用布袋除塵是最好的除塵方式，布袋除塵器以其除塵效率高、運行穩定的特點，成為目前國內外生物質鍋爐煙氣最常用的除塵方式，其除塵效率一般均大於99%，可處理不同粒徑的粉塵，達到消除黑煙、回收粉塵的目的，使得各排放指標均達到穩定排放要求。其特點如下:

1、生物質鍋爐布袋除塵器的進、出口煙道及旁通煙道均采用內置式結構，進、出口煙道被隔板分隔，通過控製煙道內的旁通閥可達成過濾狀態與旁路狀態間的切換。旁路煙道內對稱布置了4個旁路閥，若滿負荷狀態下將其同時打開，則煙氣旁路阻力低於1000 Pa。

2、生物質鍋爐布袋除塵器清灰采用PLC控製，具有定時、定壓、手動3種控製性能以及在線、離線2種噴吹控製方式。
3、生物質鍋爐布袋除塵器濾料的選用可以根據含塵氣體的溫度、濕度、粘度、酸堿性以及火星含量等因素彙總考慮。
4、在鍋爐出口的煙道上裝設冷風閥，或采用噴水降溫措施。若煙氣溫度持續上升達到旁通閥開啟溫度時，各分室提升閥關閉旁通閥打開，煙氣直接經旁路煙道排出。

5、生物質鍋爐燃燒結焦，燃燒後灰分含有焦油等物質，設備一旦溫度降低，就可能產生結焦狀況，造成堵塞狀況，由於考慮到鍋爐結焦及腐蝕問題，排煙溫度可能會在160-190℃

6、生物質鍋爐布袋除塵器設有強力的破堵、破拱裝置，由於在除塵器可能會有粉塵結塊，搭拱狀況，會造成除塵器卸灰不順，采用強力的空氣炮進行破堵。